植物体は大形、緑色～黄褐色、ときに赤色を帯びる。茎は長さ10cm以上になり、茎頂付近に多数枝を集まってつける。茎の表皮細胞は3～4細胞層からなり、透明、 螺旋状の線状肥厚があり、1～4（3～9）個の孔がある。髄は黄褐色。茎葉は長さ1.0～2.0㎜、幅0.8～0.9㎜の楕円状舌形、上部の細胞は透明で、広い区画があり、しばしば先端にささくれがある。透明細胞は2分割しない。枝葉は長さ1.5～2㎜、幅1.5～1.8㎜の広卵形、中央が凹み、縁は内曲し、歯があり、葉縁細胞と透明細胞の2種をもつ。枝葉の葉緑細胞は横断面で狭二等辺三角形。葉緑細胞と透明細胞の接合面壁は平滑。透明細胞は数本の横線の肥厚があり、表面の孔は少なく数個。雌雄異株。造精器は黄緑色～淡紅色。雌苞葉は長さ約5㎜、幅2.5～3㎜の広卵形。 胞子は直径28～33µm、黄色を帯びる。蒴は稀。
　イボミズゴケは枝葉の葉緑細胞が横断面で正三角形。透明細胞の葉緑細胞との接合面壁にはパピラがあり、ざらつき、表面からでもわかる。
　ムラサキミズゴケは普通、紫色を帯びる。枝葉の葉緑細胞は横断面で楕円形、透明細胞に挟まれ、表面には出ない。
　ホソバミズゴケはやや小小さく、赤くならない。上部の開出枝より下方に垂れる枝がかなり長い。枝葉は密につき、上半部で強く反り返る。